Takao, un estudiante de preparatoria que desea convertirse en fabricante de zapatos, se va de pinta en una mañana lluviosa y se pone a hacer sketches de zapatos en un jardín japonés.  Cierto día se encuentra con Yukino, una enigmática estudiante mayor que está bebiendo una cerveza sola.  Sin ningún acuerdo establecido, se reencuentran únicamente en los días de lluvia y poco a poco van entrando en la vida del otro.  
Así como el cielo de junio se muestra con melancolía, los recuerdos compartidos durante la temporada de lluvias van llegando a su fin.